在Blast里面进行序列比对,相似度主要看哪个值

在Blast里面进行序列比对,相似度主要看哪个值 请问如何使用blast进行多序列两两比对 运用NCBI-BLAST和PDB搜索工具搜P03958序列的相似序列和相似的结构,并对结果进行解? 克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 16SrDNA测序后在ncbi上比对细菌鉴定,16SrDNApcr扩增测序之后用blast比对,出来一个相似度99%的菌种,怎样体现数据库也是用16SrDNA序列跟我做的序列匹配的呢?换句话说,我想知道这99%相似度是不是我 如何确定这个是否是我要的目的基因序列?本人需要获得一个未知的基因,通过设计引物PCR扩增获得了一个片段,但是在进行Blast比对时,选择Highly similar sequence 的话找不到显著相似的序列,而选择 使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters replaced by X for alignment score NCBI Blast 中的黑色、蓝色、绿色、粉色和红色都是什么意思?在 NCBI 中进行核酸序列比对,比对结果的 Graphic Summary 中会有黑色、蓝色、绿色、粉色和红色的代表一些数值的标记, 我在网上找到的同一物种的两个基因,对它们序列进行了核酸比对,相似度为65%,氨基酸比对相似度为96%这样能证明这两个就是同一个基因么 如何进行BLAST比对?急救啊,朋友!本人是新手,获得了未知菌的16Srdna序列后,进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/中进行比对,页面中有BLAST Assembled Genomes和Basic BLAST之分,请教我该进入哪里,我不知道该把 怎样进行基因组中基因功能相似的多条基因序列进行多序列比对? 我把在NCBI上比对结果为99%的序列,拿来和我的序列再用DNAMAN比对一下,发现相似度只有30%了,为什么呢?我有一段序列,在NCBI上比对之后,找到一段相似度99%的序列,然后手动将这两段序列用DNAMAN比 基因序列BLAST比对时,Max ident 低于90%,可以做进化分析吗? ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南. 如何进行序列同源性分析及BLAST同源性步骤 如何进行两蛋白质序列比对? 动物dna序列为什么在ncbi上比对完和植物的该基因相似 blast检验引物特异性NCBI上没有我所要物种的某基因序列,设计引物时我用人的序列做模版,想问下还有没有blast比对的意义,如果有该怎样去比对呢,